El objetivo del presente artículo es entender, en parte, el contexto histórico de la formación de las colecciones que mantiene actualmente el Departamento de Biología de la Escuela Politécnica Nacional, así como analizar el motivo que originó el fraccionamiento de sus colecciones en el pasado y el uso que en la actualidad se les da. De igual manera se busca argumentar el rol que cumplen universidades e instituciones públicas y privadas en cuanto a la conservación y divulgación de este patrimonio natural y cultural, considerado como verdadero legado de conocimiento natural e histórico de nuestro país. Se busca también identificar potencialidades y desafíos que involucra el adecuado manejo de las colecciones biológicas, logrando una mejor interacción entre el público y las colecciones, fortaleciendo su existencia y explorando nuevas aplicaciones en diferentes sectores de la sociedad. La investigación bibliográfica, las entrevistas a curadores y encargados de otras instituciones y finalmente la revisión del repositorio de las colecciones del Departamento de Biología de la Escuela Politécnica Nacional, han permitido tener una visión panorámica y sistemática del problema y conocer los posibles motivos del fraccionamiento de dichas colecciones.